Actualmente existen tres Comisiones en el Departamento, las cuales a su vez se componen de diferentes grupos de trabajo. A continuación se relacionan estas comisiones y se identifican sus miembros.
1. Comisión Docente
Máster en Ecología: Pablo Acebes (Coord.), Isabel Castro y Anabel López. PTGAS implicado: Mª Luz Pérez.
[Esta Comisión de Coordinación Académica se hará cargo, de oficio, de los asuntos del ámbito de la docencia, gestión, seguimiento y coordinación del Máster de Ecología]
Doctorado en Ecología: Paloma Alcorlo, José Antonio González (Coord.) y Manuel Morales. PTGAS implicado: Mª Luz Pérez y Pablo Tejedo.
[Esta Comisión de Coordinación Académica se hará cargo, de oficio, de los asuntos del ámbito de la docencia, gestión, seguimiento y coordinación del Doctorado en Ecología]
Grado en Biología: Isabel Castro y Juan Traba.
[Esta comisión participará en las reuniones de la Comisión de Titulación del Grado de Biología, y transmitirá las informaciones, acuerdos y peticiones de tal Comisión a los miembros del Consejo de Departamento y viceversa]
Grado en Ciencias Ambientales: Cristina Mata y Pedro Pérez Olea.
[Esta comisión participará en las reuniones de la Comisión de Titulación del Grado de Ciencias Ambientales, y transmitirá las informaciones, acuerdos y peticiones de tal Comisión a los miembros del Consejo de Departamento y viceversa]
Laboratorios Docentes: Juan Aburto y Paloma Alcorlo.
[Esta subcomisión se encargará, de oficio, de mantener funcionales los laboratorios docentes y de gestionar su ocupación]
2. Comisión Económica
Isabel Castro, Mª Luz Pérez y Pablo Tejedo.
[Esta comisión llevará el control de los gastos económicos que son responsabilidad del Departamento de Ecología]
3. Comisión de Infraestructura y Visibilidad
Espacios: Christian Arnanz, José Antonio González, Jesús Herranz, Anabel López, Margarita Reverter y Pablo Tejedo.
[Esta subcomisión elevará al Consejo de Departamento propuestas de ocupación de los espacios e informará sobre su uso]
Seguridad: Eugenio Rico.
[Encargado de participar en las reuniones de la Comisión de Seguridad de la Facultad de Ciencias y transmitir las informaciones y decisiones de tal Comisión a los miembros del Consejo de Departamento, así como llevar un control de los aspectos relativos a la seguridad en los laboratorios y de los simulacros de seguridad]
Seminarios: Por definir.
[Encargado de dinamizar el programa de seminarios científico-divulgativos del Departamento]
Página Web: Pablo Tejedo.
[Encargado de mantener y actualizar los contenidos de la web del Departamento]
Patronato de la Fundación Fernando González Bernáldez: Juan Traba.
[Esta subcomisión fue creada para participar en las reuniones informativas y de coordinación con esta Fundación]