Caracterización de una nueva E3 ligasa que comunica inflamación y fibrosis

Línea de investigación

Compartimentación celular, homeostasis e inflamación.

Descripción

El establecimiento de un ambiente inflamatorio, y la deposición y remodelado de matriz extracelular rica en colágeno es un proceso complejo y secuencial común a la mayoría de condiciones fisiológicas de reparación tisular. Su desregulación está asociada a múltiples patologías que cursan con fibrosis y desmoplasia. Pero aún no entendemos bien los mecanismos moleculares a través de los cuales estas dos funciones se comunican y coordinan.

En nuestro laboratorio estamos interesados en nuevos mecanismos que comunican física y funcionalmente el aparato secretor celular con redes de señalización inflamatoria. El proyecto de formación del candidato/a estaría enfocado en contribuir a caracterizar una nueva E3 ubiquitin ligasa, identificada en trabajo previo del laboratorio, que potencialmente regula esta comunicación entre ambos sistemas celulares.

PLAN DE TRABAJO

• Purificación e identificación de proteínas ubiquitiladas en células wild type vs células editadas KO para nuestra diana de estudio.
• Estudios de validación utilizando aproximaciones de biología celular y bioquímica estándar.
• Ensayos funcionales para estudiar la relevancia de estos mecanismos en el control de la inflamación y secreción celular, testando sustratos específicos.
• Caracterización en modelos animales (ratón y pez cebra).

FORMACIÓN ESPECÍFICA

• Procedimientos de biología molecular (manipulación de
• ácidos nucleicos, clonaje molecular).
• Principios de cultivo celular y transfección, edición génica mediante CRISPr/Cas9.
• Procedimientos de purificación por afinidad y análisis de proteínas.
• (preparación de muestras para proteómica, análisis por western blot).
• Principios de análisis funcional de rutas de señalización
• Análisis de tejido mediante inmunohistoquímica e inmunofluorescencia en modelos animales knock out.
• Diseño e interpretación experimental, comunicación de resultados.

Contacto

Miguel Sánchez Álvarez.

Correo electrónico: msalvarez@iib.uam.es.

Instituto de Investigaciones Biomédicas Sols-Morreale (IIBM).

Número de plazas ofertadas: 2.